Kai S korporacijos vykdytojas sumoka pinigus verslui, atsiranda labai skirtingos mokestinės pasekmės priklausomai nuo to, ar mokėjimas laikomas paskola, ar klasifikuojamas kaip papildomas sumokėto kapitalo įnašas. S korporacijos paskolos grąžinimas pagrindiniam kreditoriui paprastai nelaikomas pagrindinės įmonės pajamomis. Tačiau jei pradinis mokėjimas buvo laikomas papildomu įmokėtu kapitalu, vėlesni mokėjimai pagrindinei sumai gali būti laikomi dividendų paskirstymu ar darbo užmokesčiu, kurie vėliau yra apmokestinami pagrindinei sumai ir gali apimti net savarankiško darbo mokesčius.
Kad pagrindinės įmonės įmokos S korporacijai būtų tinkamai laikomos paskolomis, Vidaus pajamų tarnyba arba IRS reikalauja, kad tarp S korporacijos ir atstovaujamojo būtų sudarytas bona fide skolos susitarimas. Jei tokio susitarimo nėra, IRS gali laikyti paskolą papildomu įmokėtu kapitalu. Sąžiningos skolos sutarties elementai apima tokius dalykus kaip:
1) S korporacijos ir atstovaujamojo rašytinė sutartis arba įsipareigojimo raštas
2) pagrįsta paskolos palūkanų norma
3) Tam tikros rūšies paskolos užstatas
4) paskolos grąžinimo grafikas
Pagrindinė šio sprendimo tema yra tikroji paskolos sutartis, kurią turi sudaryti kreditorius, kuris šiuo atveju taip pat yra ir pagrindinis kreditorius. Jei tokios apsaugos nėra, lėšos gali būti laikomos „rizikingomis“. Tai yra tas pats kaip ir su kitomis investicijomis ar įnašais į verslo įmonę. S korporacijos požiūriu, pagrindinės įmonės lėšų gavimas turėtų būti klasifikuojamas kaip skola tik tuo atveju, jei yra sudaryta tikroji skolos sutartis. Jei ne, gautos lėšos turėtų būti įrašytos kaip papildomas sumokėtas kapitalas.
Kadangi S korporacijos yra tęstinio verslo subjektai, verslo grynųjų pajamų ar nuostolių mokestinis poveikis pripažįstamas individualiomis vykdytojų mokesčių deklaracijomis. Direktoriai yra atsakingi už asmeninių atsargų ir skolų bazės sekimą versle. S korporacijos praradimo nuostoliai gali būti išskaičiuojami tik tiek, kiek bazinė suma priklauso kiekvienam vykdytojui. Priešingai, S korporacijos pajamos, viršijančios bazę, laikomos apmokestinamosiomis pajamomis. Nors pati S korporacija nėra atsakinga už jos savininkų atsargų ir skolų bazės stebėjimą, ji vis tiek turėtų aiškiai atskirti paskolų kapitalo įnašus, kad metų pabaigos finansinės ataskaitos būtų teisingos. Bet kokios S korporacijos finansinės atskaitomybės klaidos gali sukelti K-1, išleistų akcijų savininkams, klaidingumą. Taip pat nepaprastai svarbu, kad tarp S korporacijos vadovybės ir pagrindinio įnašo ar paskolinimo pinigų korporacijai būtų aiškus ryšys.
